Título não chegou
José Peseiro venceu esta temporada a Taça da Liga derrotando o FC Porto na final. Mesmo assim, o triunfo na competição não foi suficiente para merecer a continuidade no Minho.
Recorde-se que o SC Braga terminou a Liga Zon Sagres 2012/13 no quarto lugar, atrás de FC Porto, Benfica e Paços de Ferreira, falhando assim a qualificação para o Playoff da Liga dos Campeões na próxima época.
Na Taça de Portugal o SC Braga foi afastado nos quartos de final, pelo Vitória de Guimarães, que viria a vencer a prova.
Já na Liga dos Campeões, esta época, os minhotos terminaram na última posição do Grupo H, atrás de Manchester United, Galatasaray e Cluj, uma posição que os impediu de, pelo menos, seguir para a Liga Europa.
